Unter dem Museum findet man eine Reihe von großen architektonischen Stücken von verschiedenen Konstruktionen der Stadt, u.a. vom Kapitolium, einem Tempel, von dem man heute die beeindruckende Struktur eines Podiums sehen kann, daß aus Blöcken besteht, die mit Tonmörtel geglättet und mit Verputz stuckiert sind. Dieses Gebäude war der Triade "Jupiter, Juno und Minerva" gewidmet und machte in den ersten Jahrhunderten nach Christus verschiedene Variationen mit, gemäß der damaligen typischen hellenistischen Kriterien. Die Holzstrukturen wurden mit Steinelementen ausgetauscht und ein Laubengang mit dorischen und ionischen Säulen wurde errichtet. Im Museum ist eine große Abteilung der gesamten Bau-phasen des Kapitolium gewidmet, die einen Großteil ausführlicher Zeichnungen beinhaltet.

Bemerkenswert sind die zum Vorschein gekommenen Fresken und Mosaiken, die besonders zwei Gebäude charakterisieren: das "Domus degli Affreschi" und das "Domus dei Mosaici". In der ersten Wohnstätte gibt es eine enorme Anzahl von Fresken aus claudioneronischer Epoche, die ihre originale Schönheit wiedererhalten haben. An der Nordseite, zum Beispiel, ist aus verschiedenen Fragmente ein neun Meter langes Wandbild, bestehend aus Blumenmotiven auf schwarzem Grund, entstanden. Im zweiten Haus machen Mosaike aus spätrepublikanischer Epoche den Fußboden wertvoll. Die Motive sind typische römisch und stellen den Circo Massimo, Herkules, eine tanzende Gruppe, sowie Zeichnungen von Vögeln und Blumen dar.