Nel diploma di Ottone II questo paese presenta la caratteristica di un borgo mercantile sotto la competenza del vescovo di Luni. Federico I, il Barbarossa amplierà, poi, la funzione mercantile del paese per dichiarare in futuro S. Stefano Magra come borgo con un mercato. Il paese viene conteso negli anni da vari signori per la sua posizione strategica, si succedono varie rivolte, come quella per l'aumento del sale da parte di Genova. Col congresso di Vienna del 1814 si consegna la Liguria al regno sabaudo, dove si costituisce la Provincia del Levante con la sua sede a La Spezia e S. Stefano M. ne viene a far parte, dato il mandamento con Sarzana.